Equipe Interactions Plantes-Champignons et Remédiation (IPCR)

Activités de recherche

De façon spécifique, les thématiques abordées au sein de l’équipe IPCR mobilisent des approches complémentaires de biochimie et d’écologie microbienne. Elles concernent également l’étude de champignons biotrophes obligatoires et celle du métabolisme lipidique dans le cadre d’interactions plante-champignon.

Exploration et exploitation de la biodiversité de champignons telluriques saprotrophes dans le cadre de la biodégradation des polluants organiques persistants (POP) :

Nos recherches concernent l’exploitation de la biodiversité de champignons telluriques saprotrophes dans le cadre de la biodégradation des polluants organiques persistants (POP : HAP, dioxines). La compréhension des voies métaboliques fongiques impliquées dans leur dégradation (enzymes, transport et incorporation, dégradation), l’utilisation de polysaccharides naturels (amidons modifiés) comme agents de solubilisation des POP et le développement des méthodes innovantes couplant oxydation chimique (Fenton, etc.) et oxydation biologique sont en cours de développement.

Utilisation des mycorhizes dans la phytoremédiation des sols pollués et dans la protection des plantes. Etude de l’écotoxicité de divers polluants (HAP, dioxines, éléments traces métalliques et fongicides) :

Les potentialités de la symbiose mycorhizienne en termes de phytoremédiation (biodégradation, bioaccumulation, …) et de protection des plantes contre le stress induit par divers polluants ou agents phytopathogènes sont étudiées, de l’échelle du laboratoire à celle du terrain (stress oxydant, génotoxicité, métabolisme lipidique). L’élucidation des mécanismes impliqués fait appel à des approches à la fois cytologiques, biochimiques et moléculaires.

Etude de stratégies de lutte plus durables contre les champignons parasites du blé ; induction de résistance :

Deux approches visant à diminuer l’utilisation des fongicides sur le blé sont menées : caractérisation de populations de septoriose et recherche de molécules inductrices de résistances (Stimulateurs de Défense des Plantes, SDP) contre Blumeria graminis f.sp. tritici (oïdium) et Mycosphaerella graminicola(septoriose). Les activités biologiques et les effets éliciteur et  potentialisateur de ces SDP, ainsi que celles de champignons endomycorhiziens, sont évalués aux niveaux cytologique, biochimique et moléculaire par leur impact principalement sur le métabolisme des lipides et celui des formes réactives de l’oxygène.

Membres de l’équipe

BOURDON-FACON Natacha

TECH

FONTAINE Joël    

MCF-HDR

GRANDMOUGIN Anne

PR

LARUELLE Frédéric

IR

LOUNES-HADJ SAHRAOUI  Anissa

PR

MAGNIN-ROBERT Maryline

MCF

RAFIN Catherine

MCF-HDR

RANDOUX Béatrice

MCF

REIGNAULT Philippe          

PR 

TISSERANT Benoît

IR

VEIGNIE Etienne

MCF

 

Collaborations scientifiques

 Régionales :

  • BioGAP, Institut Charles Viollette – ISA de Lille
  • ProBIOGEM, Institut Charles Viollette –Université de Lille
  • Laboratoire  Génie  Civil  et  géoEnvironnement, Université de Lille

Nationales :

  •  Unité de Recherche Vigne et Vin de Champagne, URCA à Reims
  • UMR Agroécologie, INRA de Dijon
  • Arvalis-Institut du Végétal

 Internationales :

  •  Laboratoire d’Amélioration Génétique des Plantes, Université d’Annaba (Algérie)
  • Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumédiène (USTHB, Algérie)
  • Université de Djelfa
  • Helmholtz Zentrum München – German Research Centre for Environmental Health, Institute of Soil Ecology, Allemagne
  • Laboratory of Phytopathology, Université de Gand (Belgique)
  • Unité de Chimie Biologique Industrielle, Université de Liège (Gembloux Agro Bio Tech) (Belgique)
  • Laboratoire de Mycologie, Université de Louvain-la-Neuve (Belgique)
  • Agriculture et Agroalimentaire (Canada)
  • Institute for Biological Sciences (Canada)
  • Université de Wisconsin-Madison (USA)
  • Crop & Soil Systems Research Group, Scottish Agricultural College (Grande-Bretagne)
  • Faculté d’Agronomie, Université Saint-Esprit de Kaslik, université Libanaise (Liban)
  • Université Vasile Alecsandri de Bacau, Roumanie
  • Laboratoire de Génétique et Amélioration des Plantes, INAT de Tunis, Centre National de la Recherche en Agriculture Oasienne (Tunisie)
  • Centre National de la Recherche en Agriculture Oasienne (Tunisie)

Thèses en cours

Prénom Nom

Période

Titre

Alice Fourquez
2015-2018
Solutions innovantes pour la santé du blé associant applications de biostimulants et de Stimulateurs de Défense des Plantes (SDP) (Financement FUI IRIS+-PMCO, co-Direction avec Institut Viollette)

 

Contrats de Recherche

  • 2016-2018. ARIMNET – Coordination of Agricultural Research in the Mediterranean Area. BACPLANTS – Towards a sustainable agriculture by increasing plant tolerance to biotic stress under climatic change (Coordination URCA, Fr. Autres partenaires  : Institut Charles Viollette (Lille, ISA), URCA à Reims (coordinateur), INRA de Marrakech et INAT de Tunis.
  •  2016-2019. INTERREG V Fr.-Fl.-W. Portefeuille SMARTBIOCONTROL
  • 2015-2017 : FUI IRIS+ : «  Solutions innovantes pour la santé de la vigne et du blé associant applications de biostimulants et de SDP à des technologies d’imagerie et d’agroéquipement » ;Autres partenaires : INRA de Dijon, URCA, Institut Charles Viollette-ISA de Lille, Goëmar, Dijon Céréales, Tecnoma, Orange, BIBV.
  •  2014-2016 : Projet Région Nord-Pas de Calais NEWBIOPEST : « Systèmes agricoles et environnement en Nord-Pas de Calais » ; Autres partenaires : Institut Charles Viollette-ProBIOGEM, Institut Charles Viollette-ISA de Lille, Pôle Légumes.
  •  Projet BIOPROTECT (Coordination PCG, Fl.) Projet BIOSCREEN (Coordination URCA, Fr.)

Publications récentes

  • Mustafa, G., Randoux, B.,  Tisserant, B., Fontaine, J., Magnin-Robert, M., Lounès-Hadj Sahraoui, A. and Reignault, Ph. 2016. Impact of phosphorus supply and plant and mycorrhizal species on the protective efficacy of arbuscular mycorrhizal fungi against wheat powdery mildew. Mycorrhiza, in press.
  • BOUCHIAT, R., VEIGNIE E., GRIZARD D., SOEBERT CH., VIGIER M., RAFIN, C. (2016). Ability of filamentous fungi to degrade four emergent water priority pollutants. Desalination and Water treatment, Article in press.
  • LENOIR I. , FONTAINE J., LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI A. (2016) Arbuscular mycorrhizal fungal responses to abiotic stresses : a review. Phytochemistry.  123 ( 4-15).
  • LENOIR I., LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI A., LARUELLE F., DALPE Y., FONTAINE J. (2016) Arbuscular mycorrhizal wheat inoculation promotes alkane and polycyclic aromatic hydrocarbon biodegradation: microcosm experime
  • TAYEH, CH., RANDOUX, B., TISSERANT, B., KHONG, G., JACQUES, PH., REIGNAULT, PH. (2015). Are ineffective defence reactions potential target for induced resistance during the compatible wheat-powdery mildew interaction ? Plant Physiology and Biochemistry, 18: 9-19.
  • S. FIRMIN, S. LABIDI, J. FONTAINE, F. LARUELLE, B. TISSERANT, F. NSANGANWIMANA, B. POURRUT, Y. DALPÉ, A. GRANDMOUGIN, F. DOUAY, P. SHIRALI, A. VERDIN, A. LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI (2015) Arbuscular mycorrhizal fungal inoculation protects Miscanthus × giganteus against trace element toxicity in a highly metal-contaminated site. Science of The Total Environment 527 : 91-99.
  • F. NSANGANWIMANA, · B. POURRUT, · C. WATERLOT, · B. LOUVEL, · G. BIDAR, · S. LABIDI, · J. FONTAINE, · J. MUCHEMBLED, · A. LOUNÈS-HADJ · SAHRAOUI, · H. FOURRIER, · F DOUAY.(2015) Metal accumulation and shoot yield of Miscanthus giganteus growing in contaminated agricultural soils: Insights into agronomic practices. Agriculture Ecosystems & Environment 213 : 61-71.
  • LABIDI, S., FONTAINE, J., LARUELLE, F., TISSERANT, B., DALPE, Y., GRANDMOUGIN-FERJANI, A., DOUAY, F., LOUNES-HADJ SAHRAOUI A (2015). Fly ash-aided phytostabilisation of highly trace element polluted topsoils improves the telluric fungal biomass: A long-term field experiment. Applied Soil Ecology 85 : 69-75.
  • LABIDI S, BEN JEDDI F, TISSERANT B, YOUSFI M, SANAA M, DALPÉ Y, LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI A (2015) Field application of mycorrhizal bio-inoculants affects the mineral uptake of a forage legume (Hedysarum coronarium L.) on a highly calcareous soil. Mycorrhiza 25 (4) :  297-309.
  • S. DRIAI, A. VERDIN, F. LARUELLE, A. BEDDIAR, A. LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI (2015). Is the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis able to fulfil its life cycle in the presence of diesel pollution? International Biodeterioration & Biodegradation 105 : 58-65.
  • K. BENCHERIF, · A. BOUTEKRABT, · J. FONTAINE, · F. LARUELLE, · Y. DALPÈ, · A. LOUNÈS-HADJ SAHRAOUI (2015)  Impact of soil salinity on arbuscular mycorrhizal fungi biodiversity and microflora biomass associated with Tamarix articulata Vahll rhizosphere in arid and semi-arid Algerian areas. Science of The Total Environment 533 : 488-494.
  • J. MARTY, A. T. BROMAN, R. ZARNOWSKI, T. G. DWYER, L. M. BOND, A. LOUNES-HADJ SAHRAOUI, J. FONTAINE, J. M. NTAMBI, S. KELE?, CH. KENDZIORSKI, G. M. GAUTHIER.(2015). Fungal Morphology, Iron Homeostasis, and Lipid Metabolism Regulated by a GATA Transcription Factor in Blastomyces dermatitidis. PLoS Pathogens 11 (6) : e1004959.
  • Allioui N., Siah A., Brinis L., Reignault PH, Halama P. (2015). Identification of QoI-resistant genotypes of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici in Algeria. Phytopathologia Mediterrranea, Article in press.
  •  Zarnowski R., Westler W.M., Lacmbouh G.A., Maritaj.M., Bothe J.R., Bernhardt J. , Lounes-Hadj Sahraoui A., Fontaine J., Sanchez H., Hatfield R.D., Ntambi J.M., Nett J.E., Mitchell A.P., Andes D.R. D. R. 2014. Novel entries in a fungal biofilm matrix encyclopedia. mBio, 5(4), e01333-14.
  •  Calonne M., Fontaine J., Tisserant B., Dupré de Boulois H., Grandmougin-Ferjani A., Declerck S., Lounès-Hadj Sahraoui A. 2014Polyaromatic hydrocarbons impair phosphorus transport by the  arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularisChemosphere 104: 97-104.
  •  Calonne M., Fontaine J., Debiane D., Laruelle F., Grandmougin-Ferjani A., Lounès-Hadj Sahraoui A. 2014The arbuscular mycorrhizal Rhizophagus irregularis activates storage lipid biosynthesis to cope with the benzo[a]pyrene oxidative stress. Phytochemistry 97: 30-37.
  •  Calonne M., Fontaine J., Debiane D., Laruelle F., Grandmougin-Ferjani A., Lounès-Hadj Sahraoui A. 2014Impact of anthracene on the arbuscular mycorrhizal fungus lipid metabolism. Botany 92 : 173-178.
  •  Tayeh, Ch., Randoux, B., Vincent, D., Bourdon, N. and Reignault, Ph. 2014. Exogenous trehalose induces defences in wheat before and during a biotic stress caused by powdery mildew. Phytopathology, 104, 293-305.
  •  Fayeulle A., Veignie e., Slomianny C., Dewailly E., Munch I.C., Rafin C. 2014Energy- and cytoskeleton-dependent uptake of Benzo[a]pyrene by the telluric filamentous fungus Fusarium solaniEnvironmental Science and Pollution Research 21 : 3515-3523.